Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Podnl1Q6P3Y9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Podnl1Q6P3Y9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Podnl1Q6P3Y9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Podnl1Q6P3Y9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Podnl1Q6P3Y9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Podnl1Q6P3Y9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Podnl1Q6P3Y9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Podnl1Q6P3Y9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Podnl1Q6P3Y9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.1 ms