Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Frg2f1Q6P3A2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Frg2f1Q6P3A2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frg2f1Q6P3A2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Frg2f1Q6P3A2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Frg2f1Q6P3A2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms