Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Slx4Q6P1D7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Slx4Q6P1D7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Slx4Q6P1D7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Slx4Q6P1D7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Slx4Q6P1D7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Slx4Q6P1D7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Slx4Q6P1D7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Slx4Q6P1D7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Slx4Q6P1D7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Slx4Q6P1D7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Slx4Q6P1D7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Slx4Q6P1D7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Slx4Q6P1D7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Slx4Q6P1D7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Slx4Q6P1D7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Slx4Q6P1D7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Slx4Q6P1D7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Slx4Q6P1D7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Slx4Q6P1D7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Slx4Q6P1D7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Slx4Q6P1D7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Slx4Q6P1D7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Slx4Q6P1D7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Slx4Q6P1D7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Slx4Q6P1D7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Slx4Q6P1D7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Slx4Q6P1D7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Slx4Q6P1D7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Slx4Q6P1D7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Slx4Q6P1D7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Slx4Q6P1D7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Slx4Q6P1D7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Slx4Q6P1D7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Slx4Q6P1D7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Slx4Q6P1D7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Slx4Q6P1D7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Slx4Q6P1D7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Slx4Q6P1D7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Slx4Q6P1D7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Slx4Q6P1D7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Slx4Q6P1D7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Slx4Q6P1D7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Slx4Q6P1D7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Slx4Q6P1D7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Slx4Q6P1D7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Slx4Q6P1D7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Slx4Q6P1D7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Slx4Q6P1D7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Slx4Q6P1D7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Slx4Q6P1D7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Slx4Q6P1D7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Slx4Q6P1D7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Slx4Q6P1D7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Slx4Q6P1D7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Slx4Q6P1D7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Slx4Q6P1D7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Slx4Q6P1D7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Slx4Q6P1D7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Slx4Q6P1D7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Slx4Q6P1D7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Slx4Q6P1D7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Slx4Q6P1D7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Slx4Q6P1D7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Slx4Q6P1D7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Slx4Q6P1D7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Slx4Q6P1D7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Slx4Q6P1D7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Slx4Q6P1D7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Slx4Q6P1D7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Slx4Q6P1D7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Slx4Q6P1D7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Slx4Q6P1D7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Slx4Q6P1D7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Slx4Q6P1D7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Slx4Q6P1D7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Slx4Q6P1D7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Slx4Q6P1D7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Slx4Q6P1D7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Slx4Q6P1D7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms