Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp11bQ6DFW5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp11bQ6DFW5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp11bQ6DFW5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp11bQ6DFW5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms