Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rftn1Q6A0D4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rftn1Q6A0D4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rftn1Q6A0D4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.4 ms