Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF6

Begain, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BegainQ68EF6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BegainQ68EF6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BegainQ68EF6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BegainQ68EF6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BegainQ68EF6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BegainQ68EF6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
BegainQ68EF6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BegainQ68EF6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms