Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sbno1Q689Z5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sbno1Q689Z5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Sbno1Q689Z5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sbno1Q689Z5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sbno1Q689Z5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sbno1Q689Z5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sbno1Q689Z5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sbno1Q689Z5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sbno1Q689Z5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sbno1Q689Z5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sbno1Q689Z5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sbno1Q689Z5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sbno1Q689Z5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sbno1Q689Z5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sbno1Q689Z5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Sbno1Q689Z5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sbno1Q689Z5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sbno1Q689Z5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sbno1Q689Z5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sbno1Q689Z5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sbno1Q689Z5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sbno1Q689Z5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sbno1Q689Z5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sbno1Q689Z5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sbno1Q689Z5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sbno1Q689Z5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sbno1Q689Z5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sbno1Q689Z5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sbno1Q689Z5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sbno1Q689Z5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sbno1Q689Z5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sbno1Q689Z5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sbno1Q689Z5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Sbno1Q689Z5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sbno1Q689Z5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sbno1Q689Z5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sbno1Q689Z5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sbno1Q689Z5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sbno1Q689Z5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sbno1Q689Z5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sbno1Q689Z5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sbno1Q689Z5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sbno1Q689Z5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sbno1Q689Z5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sbno1Q689Z5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sbno1Q689Z5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sbno1Q689Z5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sbno1Q689Z5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sbno1Q689Z5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sbno1Q689Z5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms