Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4eQ66X19 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4eQ66X19 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp4eQ66X19 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp4eQ66X19 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp4eQ66X19 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp4eQ66X19 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp4eQ66X19 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp4eQ66X19 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp4eQ66X19 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4eQ66X19 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4eQ66X19 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp4eQ66X19 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4eQ66X19 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4eQ66X19 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp4eQ66X19 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4eQ66X19 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4eQ66X19 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlrp4eQ66X19 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlrp4eQ66X19 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4eQ66X19 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4eQ66X19 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4eQ66X19 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4eQ66X19 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4eQ66X19 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4eQ66X19 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4eQ66X19 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4eQ66X19 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4eQ66X19 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4eQ66X19 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4eQ66X19 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4eQ66X19 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4eQ66X19 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp4eQ66X19 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp4eQ66X19 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms