Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt12Q64291 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt12Q64291 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt12Q64291 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt12Q64291 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt12Q64291 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt12Q64291 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt12Q64291 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt12Q64291 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt12Q64291 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt12Q64291 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt12Q64291 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Krt12Q64291 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt12Q64291 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms