Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtmQ62388 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AtmQ62388 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AtmQ62388 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtmQ62388 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtmQ62388 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtmQ62388 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AtmQ62388 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AtmQ62388 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtmQ62388 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtmQ62388 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AtmQ62388 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AtmQ62388 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AtmQ62388 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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