Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd180Q62192 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd180Q62192 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd180Q62192 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd180Q62192 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd180Q62192 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd180Q62192 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cd180Q62192 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd180Q62192 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd180Q62192 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd180Q62192 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd180Q62192 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd180Q62192 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd180Q62192 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd180Q62192 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd180Q62192 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd180Q62192 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd180Q62192 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd180Q62192 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd180Q62192 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd180Q62192 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cd180Q62192 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd180Q62192 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms