Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbm38Q62176 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbm38Q62176 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbm38Q62176 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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