Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RhocQ62159 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RhocQ62159 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RhocQ62159 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RhocQ62159 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RhocQ62159 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RhocQ62159 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RhocQ62159 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RhocQ62159 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RhocQ62159 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RhocQ62159 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RhocQ62159 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RhocQ62159 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RhocQ62159 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RhocQ62159 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RhocQ62159 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms