Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim25Q61510 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim25Q61510 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim25Q61510 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim25Q61510 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms