Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ift88Q61371 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift88Q61371 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 281.2 ms