Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp17laQ61068 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp17laQ61068 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp17laQ61068 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms