Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp1r1bQ60829 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ppp1r1bQ60829 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppp1r1bQ60829 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppp1r1bQ60829 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppp1r1bQ60829 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppp1r1bQ60829 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppp1r1bQ60829 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppp1r1bQ60829 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppp1r1bQ60829 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppp1r1bQ60829 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppp1r1bQ60829 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppp1r1bQ60829 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppp1r1bQ60829 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppp1r1bQ60829 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppp1r1bQ60829 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms