Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prdm1Q60636 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prdm1Q60636 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Prdm1Q60636 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Prdm1Q60636 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prdm1Q60636 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prdm1Q60636 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prdm1Q60636 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm1Q60636 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm1Q60636 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prdm1Q60636 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prdm1Q60636 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prdm1Q60636 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm1Q60636 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prdm1Q60636 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms