Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mks1Q5SW45 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mks1Q5SW45 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mks1Q5SW45 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mks1Q5SW45 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms