Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms