Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tns3Q5SSZ5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tns3Q5SSZ5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tns3Q5SSZ5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tns3Q5SSZ5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tns3Q5SSZ5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tns3Q5SSZ5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tns3Q5SSZ5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tns3Q5SSZ5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tns3Q5SSZ5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Tns3Q5SSZ5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tns3Q5SSZ5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tns3Q5SSZ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tns3Q5SSZ5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tns3Q5SSZ5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tns3Q5SSZ5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tns3Q5SSZ5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tns3Q5SSZ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tns3Q5SSZ5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Tns3Q5SSZ5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tns3Q5SSZ5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tns3Q5SSZ5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Tns3Q5SSZ5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tns3Q5SSZ5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Tns3Q5SSZ5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tns3Q5SSZ5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Tns3Q5SSZ5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Tns3Q5SSZ5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Tns3Q5SSZ5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Tns3Q5SSZ5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Tns3Q5SSZ5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Tns3Q5SSZ5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Tns3Q5SSZ5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tns3Q5SSZ5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tns3Q5SSZ5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms