Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Psme4Q5SSW2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Psme4Q5SSW2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Psme4Q5SSW2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Psme4Q5SSW2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms