Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms