Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbm27Q5SFM8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbm27Q5SFM8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbm27Q5SFM8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbm27Q5SFM8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbm27Q5SFM8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rbm27Q5SFM8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rbm27Q5SFM8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rbm27Q5SFM8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rbm27Q5SFM8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rbm27Q5SFM8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbm27Q5SFM8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbm27Q5SFM8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rbm27Q5SFM8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rbm27Q5SFM8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rbm27Q5SFM8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rbm27Q5SFM8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbm27Q5SFM8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbm27Q5SFM8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbm27Q5SFM8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbm27Q5SFM8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbm27Q5SFM8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rbm27Q5SFM8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rbm27Q5SFM8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms