Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I8

Trav3-1, T cell receptor alpha variable 3-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-1Q5R1I8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav3-1Q5R1I8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav3-1Q5R1I8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav3-1Q5R1I8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav3-1Q5R1I8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav3-1Q5R1I8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav3-1Q5R1I8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav3-1Q5R1I8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav3-1Q5R1I8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trav3-1Q5R1I8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trav3-1Q5R1I8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav3-1Q5R1I8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav3-1Q5R1I8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav3-1Q5R1I8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav3-1Q5R1I8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav3-1Q5R1I8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav3-1Q5R1I8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trav3-1Q5R1I8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trav3-1Q5R1I8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav3-1Q5R1I8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav3-1Q5R1I8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav3-1Q5R1I8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav3-1Q5R1I8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav3-1Q5R1I8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav3-1Q5R1I8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trav3-1Q5R1I8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trav3-1Q5R1I8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trav3-1Q5R1I8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trav3-1Q5R1I8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trav3-1Q5R1I8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trav3-1Q5R1I8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trav3-1Q5R1I8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trav3-1Q5R1I8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trav3-1Q5R1I8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trav3-1Q5R1I8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trav3-1Q5R1I8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms