Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Mdc1Q5PSV9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Mdc1Q5PSV9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Mdc1Q5PSV9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Mdc1Q5PSV9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms