Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo39Q5NBU5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo39Q5NBU5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fbxo39Q5NBU5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms