Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdh1bQ5F204 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mdh1bQ5F204 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mdh1bQ5F204 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mdh1bQ5F204 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mdh1bQ5F204 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mdh1bQ5F204 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mdh1bQ5F204 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mdh1bQ5F204 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mdh1bQ5F204 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mdh1bQ5F204 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mdh1bQ5F204 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mdh1bQ5F204 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mdh1bQ5F204 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms