Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prpf38aQ4FK66 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prpf38aQ4FK66 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Prpf38aQ4FK66 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prpf38aQ4FK66 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms