Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Shank3Q4ACU6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Shank3Q4ACU6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Shank3Q4ACU6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Shank3Q4ACU6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Shank3Q4ACU6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Shank3Q4ACU6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Shank3Q4ACU6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Shank3Q4ACU6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Shank3Q4ACU6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Shank3Q4ACU6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Shank3Q4ACU6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Shank3Q4ACU6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Shank3Q4ACU6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Shank3Q4ACU6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Shank3Q4ACU6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Shank3Q4ACU6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Shank3Q4ACU6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Shank3Q4ACU6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Shank3Q4ACU6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Shank3Q4ACU6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Shank3Q4ACU6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Shank3Q4ACU6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Shank3Q4ACU6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Shank3Q4ACU6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Shank3Q4ACU6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Shank3Q4ACU6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Shank3Q4ACU6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Shank3Q4ACU6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Shank3Q4ACU6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Shank3Q4ACU6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Shank3Q4ACU6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Shank3Q4ACU6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Shank3Q4ACU6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Shank3Q4ACU6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Shank3Q4ACU6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Shank3Q4ACU6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Shank3Q4ACU6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Shank3Q4ACU6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms