Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam228bQ497Q6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam228bQ497Q6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fam228bQ497Q6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fam228bQ497Q6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms