Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Carmil2Q3V3V9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Carmil2Q3V3V9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Carmil2Q3V3V9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms