Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga1Q3V3R4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga1Q3V3R4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms