Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
4930567H17RikQ3V0K5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
4930567H17RikQ3V0K5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.54■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms