Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc27Q3V036 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc27Q3V036 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc27Q3V036 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc27Q3V036 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc27Q3V036 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms