Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hipk4Q3V016 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hipk4Q3V016 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hipk4Q3V016 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms