Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm6Q3UZD5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm6Q3UZD5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm6Q3UZD5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm6Q3UZD5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms