Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C87499Q3UX49 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C87499Q3UX49 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C87499Q3UX49 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms