Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec31aQ3UPL0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec31aQ3UPL0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec31aQ3UPL0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec31aQ3UPL0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec31aQ3UPL0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec31aQ3UPL0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec31aQ3UPL0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec31aQ3UPL0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sec31aQ3UPL0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sec31aQ3UPL0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sec31aQ3UPL0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec31aQ3UPL0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms