Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog7Q3UM29 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog7Q3UM29 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cog7Q3UM29 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms