Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccser2Q3UHI0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccser2Q3UHI0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccser2Q3UHI0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms