Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp36Q3UFY0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rrp36Q3UFY0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp36Q3UFY0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp36Q3UFY0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms