Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms