Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops9Q3U898 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops9Q3U898 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms