Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VwceQ3U515 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VwceQ3U515 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VwceQ3U515 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VwceQ3U515 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms