Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSG4

Alkbh5, RNA demethylase ALKBH5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh5Q3TSG4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkbh5Q3TSG4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkbh5Q3TSG4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkbh5Q3TSG4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkbh5Q3TSG4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alkbh5Q3TSG4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alkbh5Q3TSG4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alkbh5Q3TSG4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alkbh5Q3TSG4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alkbh5Q3TSG4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alkbh5Q3TSG4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alkbh5Q3TSG4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alkbh5Q3TSG4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alkbh5Q3TSG4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alkbh5Q3TSG4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alkbh5Q3TSG4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alkbh5Q3TSG4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alkbh5Q3TSG4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alkbh5Q3TSG4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alkbh5Q3TSG4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkbh5Q3TSG4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alkbh5Q3TSG4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms