Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctdnep1Q3TP92 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctdnep1Q3TP92 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ctdnep1Q3TP92 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctdnep1Q3TP92 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms