Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VrtnQ3SYK4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VrtnQ3SYK4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VrtnQ3SYK4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VrtnQ3SYK4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VrtnQ3SYK4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VrtnQ3SYK4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VrtnQ3SYK4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VrtnQ3SYK4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VrtnQ3SYK4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VrtnQ3SYK4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VrtnQ3SYK4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VrtnQ3SYK4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VrtnQ3SYK4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VrtnQ3SYK4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VrtnQ3SYK4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VrtnQ3SYK4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VrtnQ3SYK4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VrtnQ3SYK4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VrtnQ3SYK4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms