Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Shroom4Q1W617 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Shroom4Q1W617 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Shroom4Q1W617 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Shroom4Q1W617 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Shroom4Q1W617 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Shroom4Q1W617 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Shroom4Q1W617 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Shroom4Q1W617 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Shroom4Q1W617 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Shroom4Q1W617 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Shroom4Q1W617 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Shroom4Q1W617 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Shroom4Q1W617 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Shroom4Q1W617 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Shroom4Q1W617 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Shroom4Q1W617 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Shroom4Q1W617 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Shroom4Q1W617 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Shroom4Q1W617 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Shroom4Q1W617 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Shroom4Q1W617 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Shroom4Q1W617 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Shroom4Q1W617 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Shroom4Q1W617 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Shroom4Q1W617 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Shroom4Q1W617 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Shroom4Q1W617 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Shroom4Q1W617 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Shroom4Q1W617 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Shroom4Q1W617 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Shroom4Q1W617 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Shroom4Q1W617 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Shroom4Q1W617 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Shroom4Q1W617 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Shroom4Q1W617 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Shroom4Q1W617 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Shroom4Q1W617 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Shroom4Q1W617 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Shroom4Q1W617 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Shroom4Q1W617 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Shroom4Q1W617 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Shroom4Q1W617 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms