Protein–RNA interactions for Protein: Q14C37

Lemd1, LEM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd1Q14C37 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lemd1Q14C37 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lemd1Q14C37 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lemd1Q14C37 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lemd1Q14C37 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lemd1Q14C37 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lemd1Q14C37 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lemd1Q14C37 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Lemd1Q14C37 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lemd1Q14C37 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lemd1Q14C37 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lemd1Q14C37 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lemd1Q14C37 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lemd1Q14C37 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lemd1Q14C37 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Lemd1Q14C37 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lemd1Q14C37 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lemd1Q14C37 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms